8-2-6 Acquisition d'une série xzy
Une autre possibilité pour obtenir des coupes xz
- Sélectionner le mode XZY, puis en "Live" faire la mise au point sur
le plan le plus intense et réaliser les réglages.
- Toujours en mode "Live" positionner la ligne blanche pointillée au
niveau désiré pour la coupe (éventuellement réaliser une rotation du
champ pour un axe plus ou moins diagonal).
- Ouvrir le panneau "Z-Stack" et éventuellement définir des bornes
"Begin" et "End" en Y et fixer un pas "y- step size".
Note – En l'absence de bornes la coupe xz n'a qu'un seul pixel de
largeur, c'est pourquoi il est souvent intéressant de l'élargir
légèrement en fixant des bornes en Y.
- Lancer l'acquisition en cliquant sur "Start".
x
z
8-3 Acquisition de série temporelles - "Time Lapse"
Les principaux modes d'acquisition temporels sont :
xt → scan une ligne / t
xyt → scan un plan / t
xyzt → scan une série z / t
Mais on peut également utiliser des modes xzyt, xyλt, xzλt et xyzλt.
Il faut commencer par configurer le système en mode
d'acquisition non temporel comme cela a été vu dans les
chapitres précédents.
Une fois cette configuration réalisée sélectionner le mode
temporel correspondant dans "Acquisition Mode".
La sélection d'un mode temporel ouvre une fenêtre
supplémentaire "t".
La première ligne "Time interval" permet de définir
l'intervalle de temps entre deux images ou deux stacks
avec :
soit un temps fixé en remplissant les cases ;
–
soit un intervalle minimum tenant compte du
–
temps de scan des images (ou séries d'images) en
cochant "Minimize".
La partie basse de la fenêtre va permettre de définir la
durée totale de l'acquisition :
soit "Acquire until stopped" pour une durée indéfinie qui ne sera interrompue que par un stop
–
manuel de l'acquisition ;
soit "Duration" pour une durée d'acquisition définie en remplissant les cases ;
–
soit "Frames" avec le nombres d'images (ou de séries d'images) que l'on souhaite enregistrer.
–
Cliquer sur "Accept" valide le paramétrage qui va être pris en compte lors de l'activation de la touche
"Start".
Note – Les acquisitions de séries temporelles peuvent nécessiter l'utilisation des dispositifs d'incubation.
Ces procédures seront détaillées en appendice au manuel.
Note – Il est possible d'exporter les séries temporelles au format film .avi (Voir enregistrement de la
session p.38).
26