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Enfin, avant de lancer l'acquisition, il faut choisir si la mosaïque doit être sauvegardée dans son ensemble
comme une seule image ou comme une série d'images de chaque champ.
Dans la première option, il faut cocher la case "Merge Images" et, dans ce cas, il est conseillé de cocher les
cases "Auto-Stitching" et "Smooth" pour obtenir une mosaïque sans discontinuités entre les différents
éléments.
De plus s'il s'agit d'une acquisition en z il est conseillé de cocher la case "Multi frame search" du panneau
"Advanced". Ainsi, les fonctions "Auto stitching" et/ou "Smooth" seront appliquées à toutes les sections en
x, y et z ce qui offre une meilleure qualité de stitching. Dans ce cas, le temps de calcul de la reconstitution
est plus long que si seulement les cases "Auto-Stiching" et "Smooth" ont été cochées.
Si on préfère, les différentes images de la mosaïque peuvent êtres enregistrées séparément en cochant la
case "Keep Raw Images". La mosaïque peut alors être reconstituée ultérieurement en utilisant la fonction
Process → Mosaic Merge du logiciel, ou bien en utilisant d'autres logiciels.
Cliquer sur "Start" pour lancer l'acquisition.
Si l'option "Merge Images" a été choisie, les images de chaque champ sont affichées au cours de
l'acquisition, puis seule l'image finale est affichée après la reconstruction.
8-6 Imager des positions multiples – "Mark & Find"
Comme pour les mosaïques, en tout premier lieu il faut avoir initialisé la platine lors du lancement du
logiciel (voir chapitre 5 alinéa 8 – p.13) : lors du démarrage du système répondre Yes à la seconde
question : "Initialize Stage : DMI6000 Stage ?"
position basse
en appuyant sur la touche Z↓ située sur le côté droit de la base du statif.
Lorsque la platine est initialisée, aller dans l'onglet "Acquisition", et
cliquer sur l'icône "Mark & Find" ;
la fenêtre suivante s'ouvre.
Les mêmes paramètres de stacking (begin, end et Step size) peuvent être appliquées pour toutes les
positions en cochant "Same stack for all". Si cette case n'est pas cochée, il faut pour chaque position,
définir les paramètres et les enregistrer à chaque fois en appuyant sur "Apply Stack".
Le grand intérêt de la fonction "Mark & Find" réside dans la possibilité d'enregistrer quasi-simultanément
plusieurs séries temporelles soit en mode xyt, soit en mode xyzt sans avoir à décaler plusieurs sessions et
sans le risque que les conditions de chacune ne soient pas exactement les mêmes.
Dans le cas de série temporelles, pour définir le timing des acquisitions, il faut impérativement prendre en
compte le temps total d'obtention des différentes images ou des différents stacks en cliquant sur "Minimize"
puis ajouter au temps afficher autant d'intervalles de quelques secondes qu'il y a de positions, pour
permettre les déplacements de la platine.
Cliquer sur "Start" pour lancer les acquisitions.
mais uniquement après avoir vérifié que l'objectif est en
L'icône
visualise toutes les positions enregistrées.
Un clic sur l'icône
La fenêtre
en affichant dans la partie basse les coordonnées.
Un clic sur l'icône
platine.
Un clic sur l'icône
Un clic sur l'icône
trées.
L'icône
permet de redéfinir une position sélectionnée dans
la liste.
32
ouvre la fenêtre "Stage configuration".
liste toutes positions enregistrées
permet d'enregistrer la position de la
supprime la position sélectionnée.
supprime toutes les positions enregis-
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