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Guide du système MiSeq
Génération du modèle
La génération du modèle est le procédé par lequel les positions des amplifiats sur la surface entière de la
Flow Cell sont définies selon des coordonnées X et Y. Le module d'analyse en temps réel (RTA) utilise les
premiers cycles de l'analyse pour la génération du modèle.
Les images produites par chaque cycle d'imagerie suivant sont alignées sur le modèle de positions des
amplifiats généré. Les intensités individuelles des amplifiats sont extraites dans les quatre canaux de couleur
de nucléotides et les définitions des bases sont créées à partir des intensités normalisées des amplifiats.
Indicateurs de l'analyse
Les indicateurs de lʼanalyse apparaissent à lʼécran Sequencing (Séquençage) à différents moments de
lʼanalyse. Lors des étapes de génération des amplifiats, aucun indicateur nʼapparaît.
Après le début du séquençage, les indicateurs suivants apparaissent lors des cycles indiqués :
Indicateur
Intensité
Intensité et densité des amplifiats
Intensité, densité des amplifiats,
% passant le filtre, rendement et
scores de qualité
Pour obtenir les spécifications de lʼanalyse MiSeq, visitez la page de spécifications du système MiSeq sur le
site Web d'Illumina (www.illumina.com/systems/miseq/performance_specifications.ilmn).
Résultats d'analyse RTA
Le résultat de lʼanalyse RTA dʼune analyse de séquençage est un ensemble de fichiers dʼappels de bases
dont la qualité est notée (fichiers *.bcl) et qui sont créés à partir des fichiers dʼimages bruts. Pour obtenir une
liste des fichiers et dossiers RTA, consultez la section
Réalisation d'un lavage après analyse
Le lavage après analyse est le lavage standard de l'instrument réalisé entre les analyses de séquençage.
Procédez toujours au lavage de lʼinstrument après une analyse. Suivez les indications du logiciel pour charger
les composants de lavage et réaliser le lavage. Le lavage après analyse dure approximativement 20 minutes.
Commencez le lavage immédiatement après la fin d'une analyse. Le lavage de l'instrument est nécessaire
pour pouvoir configurer une analyse ultérieure. Pour effectuer un lavage après analyse à un autre moment
que directement après une analyse, utilisez la commande à l'écran Perform Wash (Procéder au lavage) pour
démarrer le lavage.
REMARQUE
Laissez la Flow Cell usagée dans l'instrument. Pour procéder au lavage de l'instrument, celui-ci doit contenir
une Flow Cell.
Document nº 1000000154717 v00 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
Trousse
Trousses de réactifs MiSeq, v3
Trousses de réactifs MiSeq, v2
Trousses de réactifs MiSeq, v1
Trousses de réactifs MiSeq, v3
Trousses de réactifs MiSeq, v2
Trousses de réactifs MiSeq, v1
Trousses de réactifs MiSeq, v3
Trousses de réactifs MiSeq, v2
Trousses de réactifs MiSeq, v1
Dossiers et fichiers RTA,
Cycle
Cycles 1 à 7
Cycles 1 à 4
Cycles 1 à 4
Cycles 8 à 25
Cycles 5 à 25
Cycles 5 à 25
Cycle 26 jusqu'à la fin de lʼanalyse
page 55.
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