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Guide du système MiSeq
Lorsque vous utilisez BaseSpace, les fichiers de données sont cryptés en transit, décryptés lors de lʼanalyse
et de nouveau cryptés lors du stockage. Lorsque vous utilisez BaseSpace Onsite, les fichiers de données
sont cryptés en transit, décryptés lors de lʼanalyse et peuvent facultativement être de nouveau cryptés lors
du stockage.
BaseSpace et BaseSpace Onsite sont automatiquement déconnectés de l'instrument MiSeq à la fin de
lʼanalyse ou dès la fin du transfert de tous les fichiers de lʼanalyse RTA. En cas dʼinterruption de la connexion
Internet, le téléchargement des fichiers de lʼanalyse continue à partir du point dʼinterruption, une fois la
connexion rétablie.
Dès que le dernier fichier de définition des bases est téléchargé dans BaseSpace ou BaseSpace Onsite,
lʼanalyse secondaire de vos données commence. BaseSpace et BaseSpace Onsite prennent en charge les
mêmes flux de travail d'analyse qu'il est possible de réaliser sur l'instrument à l'aide de Local Run Manager.
Vous pouvez vous connecter à BaseSpace à l'adresse basespace.illumina.com. Connectez-vous à lʼaide de
votre identifiant de compte MyIllumina. Pour obtenir plus de renseignements sur BaseSpace, consultez le
Guide de l'utilisateur de BaseSpace (document nº 15044182) et les pages d'aide BaseSpace sur le site Web
d'Illumina.
Pour obtenir plus de renseignements sur BaseSpace Onsite, consultez le Guide de l'utilisateur de
BaseSpace Onsite (document nº 15049148) et les pages d'aide BaseSpace Onsite sur le site Web d'Illumina.
Logiciel Local Run Manager
Le logiciel Local Run Manager est une solution intégrée sur instrument, destinée à la création d'analyses, à la
surveillance de l'état des analyses, à l'analyse des données et à l'affichage des résultats. Le logiciel s'intègre
à MCS et traite les appels de bases générés au cours de l'analyse initiale. Local Run Manager procède
automatiquement à l'analyse secondaire dès la fin de l'analyse de séquençage.
Local Run Manager sert à enregistrer de l'information sur les échantillons au moment de la préparation des
librairies et assure le suivi positif des échantillons tout au long du processus en générant de l'information à
propos de chaque échantillon.
De plus, Local Run Manager peut contrôler l'authentification des utilisateurs, si cette fonction est activée, et
accorder les autorisations associées aux différents niveaux d'accès. Les autorisations sont sauvegardées
dans un fichier de base de données indexé par l'instrument MiSeq. Local Run Manager peut également
surveiller l'analyse de séquençage. Pour obtenir plus de renseignements, consultez le Guide du logiciel
Local Run Manager (document nº 1000000002702).
Séquençage pendant l'analyse
Les ressources informatiques du système MiSeq sont dédiées au séquençage ou à l'analyse.
Avec Local Run Manager, si une nouvelle analyse de séquençage est lancée sur le système MiSeq avant la fin
de l'analyse secondaire d'une analyse précédente, une boîte de dialogue de confirmation s'affiche. Après
avoir confirmé le lancement d'une nouvelle analyse de séquençage, l'analyse secondaire de l'analyse
précédente est suspendue jusqu'à ce que la nouvelle analyse de séquençage prenne fin.
À la fin du séquençage, l'analyse secondaire de l'analyse précédente recommence automatiquement du
début.
Sequencing Analysis Viewer
Pour surveiller votre analyse plus en détail sans interférer avec celle-ci, utilisez le visualiseur d'analyse de
séquençage Sequencing Analysis Viewer (SAV) d'Illumina. L'instrument MiSeq doit être connecté au réseau
pour qu'il soit possible d'examiner les résultats d'analyse avec SAV.
Document nº 1000000154717 v00 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
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