Publicité
Chapitre 3 Séquençage
Introduction
Durée de lʼanalyse
Flux de travail MiSeq
Décongélation de la cartouche de réactifs
Inspection de la cartouche de réactifs
Dénaturer et diluer des librairies
Chargement des librairies d'échantillons
Configuration d'une analyse à l'aide de MCS
Nettoyage de la Flow Cell
Chargement de la Flow Cell
Chargement des réactifs
Démarrer l'analyse
Surveillance de l'analyse
Réalisation d'un lavage après analyse
Introduction
Pour exécuter une analyse de séquençage sur le système MiSeq, suivez les étapes de configuration décrites
dans ce chapitre.
Il y a trois modes de configuration d'analyse :
Local Run Manager : sélectionnez une analyse préparée par Local Run Manager.
u
Sample Sheet (Feuille d'échantillons) : créez une analyse à l'aide de feuilles d'échantillons. Les feuilles
u
d'échantillons sont validées dans Local Run Manager.
Manual (Manuel) : créez une analyse en entrant manuellement jusqu'à 10 cycles pour chaque lecture.
u
Aucune analyse secondaire n'est effectuée lorsque l'on choisit ce mode.
Après le lancement de l'analyse, aucune intervention supplémentaire de l'utilisateur n'est requise.
Surveillez l'analyse de séquençage à l'aide d'un des éléments suivants :
Sur l'instrument, à l'aide de l'écran Sequencing (Séquençage).
u
À distance, à l'aide du visualiseur d'analyse de séquençage (SAV). Cette application facultative est
u
disponible en téléchargement sur le site Web d'Illumina.
À distance, à l'aide de Local Run Manager.
u
Une fois l'analyse de séquençage terminée, effectuez un lavage de l'instrument.
Durée de lʼanalyse
La durée de l'analyse dépend du nombre de cycles réalisés. Vous pouvez réaliser une analyse à lectures
appariées comprenant jusqu'à 2 x 301 cycles de séquençage plus des lectures d'index avec MCS v2.3 ou les
versions ultérieures.
En outre, la durée de l'analyse est fonction de la version des réactifs MiSeq utilisés et des mises à niveau
améliorant les performances effectuées sur votre instrument.
Pour les durées attendues et autres spécifications, consultez la
sur le site Web d'Illumina.
Document nº 1000000154717 v00 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
page des spécifications du système MiSeq
17
17
18
19
20
20
21
21
23
25
26
28
29
31
17
Publicité
