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Guide du système MiSeq
Concept
Dossier d'analyse
Feuille d'échantillons
Pour obtenir plus de renseignements sur les flux de travail et les formats de fichier de manifeste, consultez le
Guide du logiciel Local Run Manager (document nº 1000000002702).
Pour obtenir plus de renseignements sur les feuilles d'échantillons, consultez le Guide de référence rapide de
la feuille d'échantillons MiSeq (document nº 15028392).
Logiciels du système
La suite logicielle de l'instrument comprend des applications intégrées qui exécutent des analyses de
séquençage, des analyses sur instrument et des fonctions connexes.
Logiciel de commande MiSeq (MCS) : commande le fonctionnement de l'instrument. L'interface du
u
logiciel de commande MCS vous guidera tout au long des étapes de chargement de la Flow Cell et des
réactifs avant le lancement de l'analyse. Un aperçu des statistiques de qualité s'affiche pendant la
progression de l'analyse.
Lors de l'analyse, MCS gère la platine de la Flow Cell, distribue les réactifs, commande la température de
u
la Flow Cell et capture les images des amplifiats sur la Flow Cell. MCS exécute l'analyse selon les
paramètres indiqués dans le logiciel Local Run Manager.
Logiciel Real-Time Analysis (RTA) : exécute les analyses d'images et la définition des bases tout en
u
affectant un score de qualité à chacune des bases, pour chacun des cycles. Les images sont
temporairement stockées dans le dossier d'analyse pour leur traitement par RTA, puis automatiquement
supprimées à la fin de l'analyse RTA.
Local Run Manager : une solution intégrée sur instrument, destinée à la création d'analyses, à la
u
surveillance de l'état des analyses, à l'analyse des données de séquençage et à l'affichage des résultats.
Local Run Manager fait également le suivi des données sur les échantillons et sert au contrôle des
autorisations des utilisateurs. Le logiciel s'exécute comme un service Windows sur l'ordinateur de
l'instrument et s'affiche dans un navigateur Web. Pour plus de renseignements consultez la section
Logiciel Local Run Manager,
Des logiciels facultatifs sont également utilisés hors de l'instrument, notamment le visualiseur d'analyse de
séquençage (Sequencing Analysis Viewer, ou SAV). Pour obtenir plus de renseignements, consultez la
section
Sequencing Analysis Viewer,
Document nº 1000000154717 v00 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
Description
Structure de dossier remplie par le logiciel RTA (dossier MiSeqOutput) ou dossier rempli
par Local Run Manager (MiSeqAnalysis). Pour plus de renseignements, consultez la
section
Dossiers d'analyse,
Fichier de valeurs séparées par des virgules (*.csv) qui contient les renseignements
servant à configurer et à effectuer une analyse de séquençage, notamment une liste des
échantillons et les séquences d'indexage correspondantes.
La feuille d'échantillons peut être fournie pendant les étapes de configuration sur le
système MiSeq. Une fois que l'analyse a commencé, la feuille d'échantillons est
renommée SampleSheet.csv et copiée dans les dossiers d'analyse : MiSeqTemp,
MiSeqOutput et MiSeqAnalysis.
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