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Pour obtenir des détails sur chaque fichier de sortie, consultez la section
séquençage,
page 66.
Gestion des erreurs
RTA2 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier RTALogs. Les erreurs sont
enregistrées dans un fichier d'erreurs au format *.tsv.
Les fichiers journaux et d'erreurs suivants sont transférés vers leur emplacement final de
sortie à la fin du traitement :
}
*GlobalLog*.tsv récapitule les événements importants survenus pendant l'analyse.
}
*LaneNLog*.tsv répertorie les événements relatifs au traitement de chaque ligne.
}
*Error*.tsv répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
}
*WarningLog*.tsv répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
Transfert de données
Tout au long de l'analyse, RTA2 requiert un transfert de données de Run Copy Service, le
logiciel qui gère le transfert vers l'emplacement du dossier de sortie spécifié. Si
BaseSpace Sequence Hub est utilisé, le BaseSpace Broker gère le transfert des données vers
BaseSpace Sequence Hub. En cas de coupure de la connexion réseau, RTA2 poursuit le
traitement et écrit les données localement. Le transfert de données reprend lorsque la
connexion est restaurée.
REMARQUE
Assurez-vous que votre connexion réseau correspond aux exigences minimales requises
pour le transfert de données d'analyse vers BaseSpace Sequence Hub. Pour plus de
renseignements, consultez le guide de préparation du site.
Une fois le traitement terminé, RTA2 crée un fichier de marqueur nommé RTAComplete.txt.
Le transfert de données s'achève après la création de ce fichier. Un indicateur de capteur
affiche l'état du transfert au bas de l'écran. Pour obtenir des détails, consultez la section
Indicateurs d'activité et de capteurs,
Guide du système HiSeq 3000
page 7.
Fichiers de sortie de
59
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