Publicité
Fichiers de sortie de séquençage
Type de fichiers
Fichiers de définition
des bases
Fichiers d'emplacement
des amplifiats
Fichiers de filtrage
Fichiers InterOp
Fichier de configuration
de Real-Time Analysis
Fichier de
renseignements sur
l'analyse
Fichiers des miniatures
66
Description, emplacement et nom des fichiers
Chaque plaque analysée est incluse dans un fichier de définition des
bases qui contient la définition des bases ainsi que le score de qualité
encodé.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X] : pour chaque ligne, les fichiers
sont enregistrés dans des dossiers par cycle.
s_[Ligne]_[Plaque].bcl.gz : « Ligne » représente le numéro à un chiffre
de la ligne et « Plaque » le numéro à quatre chiffres de la plaque. Les
fichiers de définition des bases sont compressés selon la méthode gzip.
Pour chaque plaque, un fichier d'emplacement des amplifiats contient
les coordonnées XY de chaque amplifiat. Les fichiers d'emplacement
des amplifiats sont le résultat de la génération du modèle.
Data\Intensities : un fichier correspondant à l'analyse est enregistré
dans le dossier Intensities.
s.locs
Les fichiers de filtrage spécifient si les amplifiats ont franchi les filtres.
Les fichiers de filtrage sont générés au cycle 26 et portent sur 25 cycles
de données.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X] : les fichiers sont enregistrés dans
un dossier pour chaque ligne et chaque plaque.
s_[ligne]_[plaque].filter
Les fichiers binaires sont utilisés pour le logiciel Sequencing Analysis
Viewer. Les fichiers InterOp sont mis à jour tout au long de l'analyse.
Dossier
InterOp
Créé au début de l'analyse, le fichier de configuration de Real-
Time Analysis indique les paramètres de l'analyse.
[Dossier racine]
RTAConfiguration.xml
Indique le nom de l'analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, si la
lecture est une lecture indexée et le nombre de témoins et de plaques
sur la Flow Cell. Le fichier de renseignements sur l'analyse est créé au
début de l'analyse.
[Dossier racine]
RunInfo.xml
Image miniature pour chaque canal et plaque dans chaque témoin à
chaque cycle pendant l'imagerie.
Thumbnail_Images\L00[X]\C[X.1] : les fichiers sont stockés dans un
dossier pour chaque ligne et dans un sous-dossier pour chaque cycle.
s_[ligne]_[plaque]_[canal].jpg : la plaque est représentée par un
nombre à quatre chiffres qui indique la surface, le témoin et la plaque.
Consultez la section
Numérotation des plaques,
page 68.
Support nº 20015569
Document nº 15066493 v04 FRA
Publicité
