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Écran Advanced (Paramètres avancés)
1
[Facultatif]
Un rapport de la première base est généré automatiquement pour chaque analyse après
le cycle 2 et placé au niveau de la racine du dossier de l'analyse. En sélectionnant cette
option, vous pouvez confirmer le rapport de la première base avant de procéder à
l'analyse. Dans le cas contraire, l'analyse continue sans afficher la boîte de dialogue de
confirmation.
2
[Facultatif]
Toutes les lignes sont incluses par défaut. L'alignement PhiX s'exécute
automatiquement pour toutes les lignes.
3
Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Recipe (Formule)
Une formule est générée automatiquement à partir des renseignements saisis sur l'écran
Recipe (Formule).
1
Sélectionnez une option Index Type (Type d'index) :
}
No Index (Sans index) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée
sans index.
}
Single Index (Index simple) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture
appariée avec une seule lecture d'indexage.
}
Dual Index (Index double) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture
appariée avec deux lectures d'indexage.
}
Custom (Personnalisé) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée
avec un nombre personnalisé de cycles pour les lectures d'index.
2
Entrez le nombre de cycles pour la lecture 1 et la lecture 2, le cas échéant.
3
Si vous avez sélectionné l'option d'indexage Custom (Personnalisé), saisissez le
nombre de cycles pour chaque lecture d'index.
4
Vérifiez les paramètres de chimie suivants, générés automatiquement.
}
SBS : HiSeq 3000/4000 SBS Kit (Trousse SBS HiSeq 3000/4000) : indique la
chimie SBS utilisée pour la lecture 1 et la lecture 2.
}
Index : HiSeq 3000/4000 Sequencing Primer (Primer de séquençage
HiSeq 3000/4000) ou HiSeq 3000/4000 Dual Index Sequencing Primer (Primer de
séquençage à index double HiSeq 3000/4000) : indique la chimie utilisée pour les
lectures d'index.
}
PE turnaround (Rotation des paires de bases appariées) : HiSeq 3000/4000 PE (HiSeq
3000/4000, lecture appariée) ou HiSeq 3000/4000 PE Dual Index (HiSeq 3000/4000,
lecture appariée à index double) :affiche la chimie utilisée pour la resynthèse
appariée.
5
[Facultatif]
utiliser une formule personnalisée.
Guide du système HiSeq 3000
Cochez la case Confirm First Base (Confirmer la première base).
Sur l'image de la Flow Cell, sélectionnez les lignes à retirer de l'analyse.
REMARQUE
Une lecture comprend un cycle de plus que le nombre de cycles analysés. Par exemple,
pour effectuer 125 cycles pour la lecture 1, entrez 126.
REMARQUE
Il n'est pas nécessaire que les longueurs de séquences correspondent.
Cochez la case Use Existing Recipe (Utiliser la formule existante) pour
25
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