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illumina HiSeqMD 3000 Guide page 75

Guide du système

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Structure du dossier de sortie
Config : paramètres de configuration de l'analyse.
Data
Intensities
s.locs
Images
Focus
InterOp : fichiers binaires utilisés par le logiciel Sequencing Analysis Viewer.
Logs : fichiers journaux décrivant les évènements de fonctionnement.
Recipe : fichier de formule propre à l'analyse portant l'identifiant de la cartouche de
réactifs.
RTALogs : fichiers journaux décrivant les évènements de RTA2.
Thumbnail_Images : miniatures des neuf emplacements d'un sous-ensemble de
plaques, générées pour chaque cycle et pour chaque base.
RTAConfiguration.xml
RunInfo.xml
RunParameters.xml
Nom et chemin d'accès des dossiers de l'analyse
Le dossier de l'analyse est le dossier racine réceptionnant les données de sortie d'une
analyse de séquençage. Lors de la configuration de l'analyse, le logiciel vous invite à saisir
le chemin d'accès au dossier de l'analyse. Par défaut, le dossier est nommé selon le format
suivant :
AAMMJJ_<Nom de l'ordinateur>_<Numéro de l'analyse>_<Côté de la
Flow Cell><Identifiant de la Flow Cell>
Exemple :
La numérotation de l'analyse augmente par incréments de 1 à chaque fois que l'instrument
effectue une analyse de séquençage. Le côté de la Flow Cell (A) et l'identifiant de la
Flow Cell saisis au cours des étapes de configuration de l'analyse sont ajoutés au nom de
fichier de l'analyse.
Le dossier de l'analyse est enregistré suivant le chemin de sortie indiqué lors de la
configuration de l'analyse. Le dossier temporaire de l'analyse est enregistré dans le
lecteur D:.
Guide du système HiSeq 3000
BaseCalls
L00[X] : fichiers de définition des bases de chaque ligne, rassemblés dans
un fichier par cycle.
L00[X] : images de mise au point pour chaque ligne.
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