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illumina iScan Documentation Produit page 53

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Documentation produit du système iScan
Composant
du nom du
Description
fichier
Bande
Section numérotée commençant en haut à gauche d'un échantillon sur une
puce BeadChip.
Strie
Certaines bandes de puces BeadChip sont mises en image en utilisant deux ou
trois bandes plus petites, appelées « stries ». Le nom de la strie fait référence à
l'emplacement de l'image dans chaque bande. Par exemple, dans une bande à
2 stries, la strie 1 est l'image de la moitié supérieure de la bande et la strie 2,
celle de la moitié inférieure de la bande.
Canal
RED ou GRN pour le canal rouge ou vert respectivement.
Extension
Images décompressées—*.tiff
Images compressées—*.jpeg ou *.png
Échec de l'enregistrement ou du balayage
L'enregistrement et l'extraction sont essentiels pour obtenir les résultats des essais.
Si l'enregistrement ou le balayage d'une ou de plusieurs bandes échoue dans une section
d'échantillons, vous pouvez rebalayer les bandes en sélectionnant Rescan (Balayer de nouveau) à
l'écran Review (Révision) de l'iCS. Lors du rebalayage, de nouveaux fichiers de données d'intensité sont
générés.
Lorsque les sections d'une puce BeadChip en échec sont immédiatement rebalayées dans la session
de balayage en cours, de nouveaux fichiers images sont créés uniquement pour les sections balayées.
Tous les fichiers images sont recréés lorsque l'intégralité de la puce BeadChip est balayée.
Si vous sélectionnez Done (Terminé) à l'écran Review (Révision) sans rebalayer les sections en échec,
vous créerez des fichiers IDAT sans les données des sections en échec, ce qui pourrait réduire les
performances ou les résultats du test. Rebalayez toute la section d'échantillons au cours d'une autre
session pour générer des fichiers IDAT complets.
Lorsque vous rebalayez toute la puce BeadChip ou des sections de la puce BeadChip au cours d'une
autre session, de nouveaux indicateurs et de nouveaux fichiers IDAT/GTC et QC sont créés.
Ces nouveaux fichiers viennent remplacer les fichiers existants. Pour éviter que les fichiers soient
écrasés, sauvegardez les données générées lors du nouveau balayage dans un autre dossier de
données de sortie.
Document nº 1000000161301 v01 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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