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Documentation produit du système iScan
Un fichier IDAT est généré lorsque les données d'enregistrement de toutes les bandes sont
présentes pour un échantillon donné. Un fichier IDAT est toujours généré lorsque toutes les
bandes ont été balayées et ce, quel que soit leur résultat d'enregistrement ou tout autre
indicateur métrique. Si une erreur matérielle se produit et qu'au moins une bande de l'échantillon
n'a pas été balayée, aucun fichier IDAT n'est généré pour l'échantillon.
Données normalisées
Si la fonction AutoConvert est activée lors du balayage, l'iCS normalise les données des fichiers IDAT et
génère des typages génotypiques à partir des données normalisées. Les données normalisées et les
typages génotypiques sont sauvegardés dans des fichiers de typage génotypique (*.gtc). Pour obtenir
plus de renseignements, consultez la rubrique
génotypiques, page 32
Les fichiers IDAT et (le cas échéant) GTC sont sauvegardés sur l'ordinateur de commande de
l'instrument ou le réseau dans le sous-dossier de l'identifiant (code à barres) de la puce BeadChip,
dans le dossier du chemin de sortie.
Renseignements concernant la configuration du scanner
Le fichier Effective.cfg est créé lorsqu'un balayage est lancé. Le fichier contient tous les
renseignements concernant la configuration du scanner pour le balayage en cours. Il est sauvegardé
dans le dossier de l'identifiant de la puce BeadChip dans le chemin de sortie.
Images
Chaque fichier image (*.tiff, *.jpeg ou *.png) est sauvegardé sur l'ordinateur de commande de
l'instrument ou le réseau. Les fichiers images sont sauvegardés dans le dossier de l'identifiant (code à
barres) de la puce BeadChip, dans le dossier du chemin de sortie. Des noms de fichiers pour chaque
nœud individuel sont générés en fonction de la position de la section dans la puce BeadChip.
Les fichiers sont nommés selon la nomenclature suivante : ID_ÉTIQUETTE_BANDE_STRIE_
CANAL.EXTENSION
Composant
du nom du
Description
fichier
ID
Le numéro de série (ou code à barres) de la puce BeadChip.
Étiquette
Fait référence à l'emplacement de l'échantillon sur la puce BeadChip.
•
Les puces Quad sont étiquetées au format suivant : R01C01, R02C01, R01C02,
R02C02
•
Les puces Duo sont étiquetées au format suivant : A, B
Document nº 1000000161301 v01 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Générer des données normalisées et des typages
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