Publicité
Documentation produit du système iScan
5.
[Facultatif]
Modifiez le fichier de mappage comme suit :
a. Sélectionnez Edit Mapping File (Modifier le fichier de mappage).
b. Dans la boîte de dialogue AutoConvert Mapping (Mappage AutoConvert), mettez en
surbrillance le mappage que vous souhaitez modifier ou sélectionnez New (Nouveau) pour
créer un mappage. Lors de la création d'un mappage, la ligne est remplie à l'aide des entrées
par défaut.
c. Sélectionnez le champ PartNumber (Référence) dans le volet de droite et entrez ou modifiez la
référence de la puce BeadChip. La référence du produit se trouve sur l'emballage de la puce
BeadChip.
d. Sélectionnez le champ ManifestFilePath (Chemin d'accès au fichier de manifeste),
sélectionnez la commande de navigation, naviguez jusqu'à l'emplacement du fichier bead pool
manifest (*.bpm) et sélectionnez-le.
e. Sélectionnez le champ ClusterFilePath (Chemin d'accès au fichier de groupement),
sélectionnez la commande de navigation, naviguez jusqu'à l'emplacement du fichier
d'amplifiats de bille (*.egt) et sélectionnez-le.
f.
Sélectionnez OK.
6.
Dans la boîte de dialogue Options, sélectionnez OK.
Spécifier les chemins d'entrée et de sortie
Le système iScan obtient les renseignements du fichier de traitement à partir du chemin d'entrée.
Le chemin de sortie correspond à l'emplacement où tous les fichiers sont enregistrés à la fin du
balayage. Lorsque le système iScan s'exécute sous le LIMS, vous ne pouvez pas changer les chemins
d'entrée et de sortie. Ces chemins sont spécifiés par le logiciel de gestion de projets LIMS.
Indiquez les chemins d'entrée et de sortie comme suit.
1.
À l'écran Setup (Configuration) de l'iScan Control Software (iCS), en regard du chemin d'entrée ou
de sortie, sélectionnez Browse (Parcourir).
2.
Accédez aux dossiers appropriés et sélectionnez OK.
•
Input Path (Chemin d'entrée) : le dossier qui contient les sous-dossiers pour toutes les puces
BeadChip que vous balayez. Assurez-vous que les sous-dossiers sont nommés avec le
numéro du code à barres de chaque puce BeadChip et qu'ils contiennent les fichiers DAMP et
SDF pour chaque puce BeadChip.
Output Path (Chemin de sortie) : le dossier où vous souhaitez que l'iCS enregistre les fichiers
•
images (*.jpg, *.png ou *.tif), les fichiers d'emplacement de bille (*.locs) lors de
l'enregistrement des *.tifs, les indicateurs métriques de balayage (*.txt) et les fichiers de
données d'intensité (*.idat) pour chaque puce BeadChip. La sortie pour chaque puce BeadChip
est enregistrée dans un sous-dossier dont le nom correspond au numéro du code à barres de
la puce BeadChip.
Document nº 1000000161301 v01 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
33
Publicité
