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Documentation produit du système iScan
Indicateurs métriques de balayage
Les indicateurs métriques de balayage pour chaque puce BeadChip s'affichent dans le tableau des
indicateurs métriques de balayage en haut de l'écran Review (Révision). Utilisez ce tableau pour passer
en revue les valeurs d'intensité des canaux rouge et vert, ainsi que pour vérifier les indicateurs
métriques d'enregistrement et de mise au point pour chaque bande BeadChip. Vous pouvez également
utiliser ce tableau pour déterminer si les données d'intensité ont été normalisées pour chaque section
de puce BeadChip balayée.
Indicateurs métriques de mise au point
L'indicateur métrique de mise au point se situe entre 0 et 1. Plus le niveau de mise au point est élevé,
plus les images de bille sont nettes et définies. Un niveau de mise au point faible indique que les images
de bille ne sont pas bien définies et que les couleurs de bille déteignent les unes sur les autres.
Indicateurs métriques d'enregistrement
La valeur d'enregistrement varie en fonction du type de puce BeadChip. La valeur se situe entre 0 et 1
(plusieurs stries par puce BeadChip) ou entre 0 et 2 (une seule strie par puce BeadChip). Lorsque
l'enregistrement de la bande est inférieur à 0,75, la bande est marquée comme mal enregistrée et
apparaît en rouge dans la fenêtre Scan Progress Indicator (Indicateur de progression du balayage).
Les sections mal enregistrées peuvent être balayées de nouveau. Pour obtenir plus de
renseignements, consultez la rubrique
Indicateurs métriques de normalisation
La colonne AutoConvert affiche l'un des indicateurs métriques de normalisation suivants pour chaque
section de puce BeadChip balayée :
•
Converted (Converti) : le fichier IDAT pour cette section de puce BeadChip a été converti en fichier
GTC. Les données d'intensité ont été normalisées et les typages génotypiques ont été générés.
Pour obtenir plus de renseignements, consultez la rubrique
des typages génotypiques,
N/A (S. O.) : la fonctionnalité AutoConvert n'a pas été activée pour ce balayage. Pour obtenir plus
•
de renseignements, consultez la rubrique
génotypiques,
page 32.
•
Not Converted (Non converti) : la fonctionnalité AutoConvert a été activée pour ce balayage, mais
le fichier IDAT pour cette section de puce BeadChip section n'a pas été converti en fichier GTC.
Pour obtenir des renseignements sur le dépannage, consultez la rubrique
page 39.
Document nº 1000000161301 v01 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Surveiller la progression du balayage,
page 32.
Générer des données normalisées et des typages
page 36.
Générer des données normalisées et
Fichiers journaux,
40
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