Publicité
Guide du système MiniSeq
Structure des dossiers de sortie de séquençage
Le logiciel de commande génère automatiquement le nom du dossier de sortie.
Configs
Data (Données)
Intensities (Intensités)
BaseCalls (Appels de bases)
L001 : fichiers de définition des bases rassemblés par cycle
L001 : fichier *.locs rassemblant les emplacements des amplifiats
Images
Focus (Mise au point)
L001 : images de mise au point
InstrumentAnalyticsLogs : fichiers journaux décrivant les étapes des analyses sur l'instrument
InterOp : fichiers binaires utilisés par le logiciel Sequencing Analysis Viewer
Logs : fichiers journaux décrivant les étapes de fonctionnement
Recipe : fichier de formule propre à l'analyse portant l'identifiant de la cartouche de réactifs
RTALogs : fichiers journaux décrivant les étapes de l'analyse
RTAComplete.xml
RTAConfiguration.xml
RunInfo.xml
RunNotes.xml
RunParameters.xml
Exigences relatives aux fichiers d'entrée de l'analyse
Pour effectuer l'analyse ou pour remettre l'analyse en file d'attente, Local Run Manager requiert les fichiers
suivants générés au cours de l'analyse de séquençage. Certains modules d'analyse exigent des fichiers
d'entrée supplémentaires pour effectuer l'analyse. Pour obtenir plus de renseignements, consultez le guide
du flux de travail correspondant au module d'analyse que vous utilisez.
No m /T ype de f ichier
RTAComplete.txt
RunInfo.xml
Fichiers de définition des
bases (*.bcl)
Fichiers filtres (*.filter)
Fichiers d'emplacement
des amplifiats (*.locs)
Document n° 1000000002695 v05 FRA Support nº 20014309
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Descriptio n
Un fichier de marqueurs indiquant que le traitement RTA est terminé. La présence de ce
fichier indique à Local Run Manager de mettre l'analyse en file d'attente.
Contient des renseignements généraux sur lʼanalyse, tels que le nombre de lectures et de
cycles de lʼanalyse de séquençage, et indique si une lecture est indexée ou non.
Contient la définition des bases et un score de qualité codé pour chaque amplifiat de
chaque plaque, le tout rassemblé dans un fichier par cycle.
Indique si un amplifiat a passé les filtres. Les renseignements de filtrage sont rassemblés
dans un fichier de filtrage pour chaque lecture.
Contient les coordonnées XY de chaque amplifiat sur chaque plaque, rassemblées dans
un fichier d'emplacement des amplifiats.
49
Publicité
