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Guide du système MiniSeq
La mise en phase se produit lorsqu'un brin a un retard d'une base.
u
La mise en préphase se produit lorsqu'un brin a une avance d'une base.
u
Figure 31 Mise en phase et en préphase
A Lecture avec une base présentant une mise en phase
B Lecture avec une base présentant une mise en préphase
RTA2 corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase, ce qui maximise la qualité des
données à chaque cycle tout au long de l'analyse.
Définition des bases
La définition des bases détermine une base (A, C, G ou T) pour chaque amplifiat d'une plaque donnée d'un
cycle spécifique. Le système MiniSeq utilise un séquençage à deux canaux, qui ne nécessite que
deux images pour encoder les données de quatre bases d'ADN, une provenant du canal rouge et une autre
du canal vert.
Les intensités extraites d'une image et sa comparaison avec une autre image donnent quatre populations
distinctes, chacune correspondant à un nucléotide. Le processus de définition des bases détermine à quelle
population appartient chaque amplifiat.
Figure 32 Visualisation de l'intensité des amplifiats
Tableau 1 Définition des bases dans le séquençage à deux canaux
Base
Canal ro ug e
A
1 (allumé)
C
1 (allumé)
G
0 (éteint)
T
0 (éteint)
Document n° 1000000002695 v05 FRA Support nº 20014309
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Canal vert
Résultat
1 (allumé)
Amplifiats montrant une intensité tant dans le canal rouge que dans le
canal vert.
0 (éteint)
Amplifiats montrant une intensité seulement dans le canal rouge.
0 (éteint)
Amplifiats ne montrant d'intensité dans aucun emplacement connu.
1 (allumé)
Amplifiats montrant une intensité seulement dans le canal vert.
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