Télécharger Imprimer la page

illumina MiniSeq Guide page 42

Guide du système
Masquer les pouces Voir aussi pour MiniSeq:

Publicité

Guide du système MiniSeq
Les fichiers temporaires peuvent finir par remplir l'espace du disque dur. Songez à utiliser un emplacement
réseau pour stocker les données d'analyse et pensez à définir une stratégie de conservation raisonnable
dans Local Run Manager en fonction du nombre d'analyses que vous comptez effectuer.
Erreurs RTA
Pour résoudre les problèmes RTA, vérifiez d'abord le journal des erreurs RTA stocké dans le dossier
RTALogs. Ce fichier n'est pas présent pour les analyses réussies. Joignez le journal des erreurs lors du
signalement des problèmes à l'assistance technique d'Illumina.
Gestion des erreurs
RTA2 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier RTALogs. Les erreurs sont enregistrées dans
un fichier d'erreurs au format *.tsv.
Les fichiers journaux et d'erreurs suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du
traitement :
*GlobalLog*.tsv récapitule les événements importants survenus pendant l'analyse.
u
*LaneNLog*.tsv répertorie les événements relatifs au traitement. « N » est toujours égal à un sur la
u
Flow Cell d'un système MiniSeq.
*Error*.tsv répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
u
*WarningLog*.tsv répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
u
Flux de travail de réhybridation
Une analyse de réhybridation peut être nécessaire si les indicateurs générés au cours des quelques premiers
cycles montrent des intensités inférieures à 2 500. On s'attend à ce que certaines librairies à faible diversité
aient des intensités inférieures à 1 000, ce qui ne peut être résolu par une réhybridation.
REMARQUE
L'utilisation de la commande End Run (Terminer l'analyse) est définitive. L'analyse ne peut pas reprendre,
les consommables ne peuvent pas être réutilisés et les données de séquençage de l'analyse ne sont pas
enregistrées.
Lorsque vous mettez fin à une analyse et enregistrez la Flow Cell, le logiciel effectue les étapes suivantes
avant la fin de l'analyse :
Il place la Flow Cell en état de sécurité.
u
Il déverrouille la RFID de la Flow Cell pour une future analyse.
u
Il attribue une date de péremption de réhybridation à la Flow Cell.
u
Il écrit les journaux de l'analyse pour les cycles terminés. Un délai est normal.
u
Il ignore le lavage automatique après analyse.
u
Lorsque vous démarrez une analyse de réhybridation, le logiciel effectue les étapes d'analyse suivantes :
Il crée un dossier d'analyse basé sur le nom unique de l'analyse.
u
Il vérifie que la date de réhybridation de la Flow Cell n'est pas arrivée à expiration.
u
Il amorce les réactifs. Un délai est normal.
u
Il ignore l'étape de génération d'amplifiats.
u
Il retire le primer de lecture 1 précédent.
u
Document n° 1000000002695 v05 FRA Support nº 20014309
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
37

Publicité

loading