Exigences Relatives Aux Feuilles D'échantillons - illumina iSeq 100 Guide

Masquer les pouces Voir aussi pour iSeq 100:
Table des Matières

Publicité

Guide du système de séquençage iSeq 100
6
Dans la liste Set Region (Configurer la région), sélectionnez le lieu géographique où se situe le système ou
le lieu le plus proche du lieu où se situe le système.
Ce paramètre garantit que les données sont stockées à l'endroit approprié pour BaseSpace Sequence
Hub.
7
Si vous avez un abonnement Entreprise, dans la champ Private Domain (Domaine privé), saisissez le nom
du domaine (URL) utilisé pour l'ouverture de session propre à BaseSpace Sequence Hub.
Par exemple : https://votrelabo.basespace.illumina.com.
8
Sélectionnez Next (Suivant).
9
Choisissez si vous souhaitez intégrer le logiciel de commande à Local Run Manager :
Pour créer des analyses et analyser les données dans Local Run Manager, sélectionnez Use Local
u
Run Manager (Utiliser Local Run Manager).
Pour créer des analyses dans le logiciel de commande et analyser les données dans une autre
u
application, sélectionnez Use Manual Mode (Utiliser le mode manuel).
Local Run Manager offre le flux de travail le plus rationalisé, mais n'est pas une fonction du logiciel de
commande. C'est un logiciel intégré servant à l'enregistrement des échantillons pour le séquençage, à la
création d'analyses et à l'analyse des données. Avant le séquençage, consultez le Guide du logiciel
Local Run Manager (document nº 1000000002702).
10 Sélectionnez Next (Suivant).
11 Passez les paramètres en revue. Pour modifier un paramètre :
a
Sélectionnez Edit (Modifier) pour ouvrir le paramètre.
b Modifiez le paramètre selon vos besoins, puis sélectionnez Next.
c
Sélectionnez Next pour poursuivre sur les écrans suivants.
Sur l'écran Settings Review (Passer en revue les paramètres), un crochet vert indique que les paramètres
sont activés.
12 Sélectionnez Save (Enregistrer).
13 Pour fermer les Paramètres du système, sélectionnez Exit (Quitter).
Exigences relatives aux feuilles d'échantillons
Une feuille d'échantillons est requise pour chaque analyse lorsque le système est configuré en mode manuel
et que vous analysez les données dans BaseSpace Sequence Hub. Créez une feuille d'échantillons en
modifiant le modèle de feuille d'échantillons du système iSeq 100 destiné au mode manuel et en l'important
ensuite dans le logiciel de commande pendant la configuration de l'analyse. Après l'importation, le logiciel
renomme automatiquement la feuille d'échantillons en SampleSheet.csv.
Téléchargez le modèle de feuille d'échantillons sur les pages d'assistance du système de séquençage
iSeq 100 :
modèle de feuille d'échantillons du système iSeq 100 destiné au mode
ATTENTION
Pour le système de séquençage iSeq 100, saississez les séquences des adaptateurs de l'index 2 (i5) dans la
bonne orientation. Pour les orientations de l'index, consultez le document sur les séquences des
adaptateurs Illumina (document nº 1000000002694).
Une feuille d'échantillons est aussi requise lorsque le système est configuré en mode Local Run Manager.
Toutefois, le logiciel Local Run Manager crée la feuille d'échantillons pour vous et l'enregistre à l'emplacement
approprié. Une feuille d'échantillons est facultative dans tous les autres cas.
Document nº 1000000036024 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
manuel.
14

Publicité

Table des Matières
loading

Table des Matières