Nom Et Emplacement Du Dossier De Sortie - illumina iSeq 100 Guide

Guide du système de séquençage iSeq 100
Type de fichiers Description, emplacement et nom des fichiers
Fichier Le fichier d'emplacement des amplifiats (s.locs) contient les coordonnées X et Y de chaque
d'emplacement des amplifiat sur la Flow Cell.
Data\Intensities
amplifiats
s.locs
Fichiers de filtrage Les fichiers de filtrage précisent si les amplifiats ont franchi le filtre. Un fichier de filtrage est
généré pour chaque plaque. Les fichiers de filtrage sont générés au cycle 26 et portent sur
25 cycles de données.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
s_[ligne].filter
Fichiers InterOp Indicateurs en temps réel de la qualité de l'analyse, mis à jour tout au long de l'analyse. Ces
fichiers binaires regroupent les mesures relatives aux plaques et aux cycles ainsi que les
mesures réalisées lors des lectures. Ils sont nécessaires pour afficher les mesures dans le
visualiseur d'analyse de séquençage.
Dossier
Fichier de Liste des paramètres de l'analyse. Créé au début de l'analyse, ce fichier combine les valeurs
configuration RTA du fichier de configuration d'entrée et les valeurs définies par RTA2.
[Dossier racine], RTAConfiguration.xml
Fichier de Il indique le nom de l'analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, le fait que la lecture est
renseignements sur une lecture d'index ou non et le nombre de témoins et de plaques. Le fichier est créé au début
l'analyse* de l'analyse.
[Dossier racine], RunInfo.xml
Fichiers des Images miniatures des plaques de Flow Cell.
Images\L001\C[X.1] : les fichiers sont stockés dans un seul dossier pour chaque ligne et un
miniatures
sous-dossier pour chaque cycle.
s_[ligne]_[plaque].jpg : l'image miniature comprend le numéro de la plaque.
* Créé par le logiciel de commande. RTA2 crée tous les autres fichiers indiqués dans le tableau.
Local Run Manager et BaseSpace Sequence Hub convertissent automatiquement les fichiers de définition
des bases en fichiers FASTQ. Lors du séquençage en mode manuel, utilisez la dernière version du logiciel de
conversion bcl2fastq2 pour convertir les fichiers FASTQ. Téléchargez le logiciel sur les
logiciel de conversion bcl2fastq

Nom et emplacement du dossier de sortie

Pour chaque analyse, le logiciel de commande génère automatiquement un dossier de sortie et un dossier
d'analyse. Accédez aux données de l'analyse à partir du dossier de sortie, ce dernier étant une copie du
dossier de l'analyse. Le dossier de l'analyse est destiné à une utilisation par le système.
L'emplacement du dossier de sortie est défini par l'utilisateur, mais se retrouve par défaut sur le lecteur D:\.
Le logiciel de commande nomme le dossier de sortie dans le format suivant.
Format
<AAAAMMJJ>_<Identifiant de l'instrument_<Numéro de l'analyse>_
<Identifiant de la Flow Cell>
La numérotation de l'analyse augmente de un chaque fois qu'une analyse est effectuée. L'instrument et la
Flow Cell sont identifiés par des numéros de série.
Document nº 1000000036024 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
InterOp
sur le site Web d'Illumina.
pages d'assistance du
Exemple
20180331_FFSP247_4_BNS417-05-25-
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