illumina NextSeq 550Dx Guide De Référence page 86

Guide de référence de l'instrument NextSeq 550Dx
Type de fichiers Description, emplacement et nom des fichiers
Fichier de Créé au début de la série, le fichier de configuration RTA répertorie les
configuration paramètres de la série.
RTA
[Root folder], RTAConfiguration.xml
Fichier de Indique le nom de la série, le nombre de cycles à chaque lecture, si la lecture
renseignements est une lecture indexée et le nombre de témoins et de plaques sur la Flow
sur la série Cell. Le fichier de renseignements sur la série est créé au début de celle-ci.
[Root folder], RunInfo.xml
Plaques de la Flow Cell
Les plaques sont de petites zones d'imagerie sur la flow cell définies comme le champ de vision par la
caméra. Le nombre total de plaques dépend du nombre de lignes, de témoins et de surfaces qui sont
imagés sur la flow cell, et de la manière dont les caméras fonctionnent ensemble pour collecter les
images. Les flow cell à haut débit ont un total de 864 plaques.
Tableau 2 Plaques de la Flow Cell
Composants de Haut
la Flow Cell débit
Lignes
Surfaces
Témoins par
ligne
Segments de
caméra
Plaques par
témoin par
segment de
caméra
Nombre total de
plaques imagées
Document n° 1000000009513 v08
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT.
Description
4 Une ligne est un canal physique possédant des ports d'entrée et
de sortie dédiés.
2 La flow cell est imagée sur deux surfaces : les surfaces inférieure
et supérieure. La surface supérieure d'une plaque est imagée, puis
la surface inférieure de la même plaque est imagée avant de
passer à la plaque suivante.
3 Un témoin est une colonne de plaques dans une ligne.
3 L'instrument utilise 6 caméras pour imager la flow cell en
3 segments pour chaque ligne.
12 Une plaque est la zone de la flow cell que la caméra voit
comme 1 image.
864 Le nombre total de plaques est égal à lignes × surfaces × témoins
× segments de caméra x plaques par témoin par segment.
78