illumina NextSeq 550Dx Guide De Référence page 85

Guide de référence de l'instrument NextSeq 550Dx
Fichiers de sortie de séquençage
Type de fichiers Description, emplacement et nom des fichiers
Fichiers de Chaque plaque analysée est incluse dans un fichier agrégé de définition des
définition des bases (*.bcl.bgzf) pour chaque ligne et pour chaque cycle. Le fichier agrégé
bases contient la définition des bases ainsi que le score de qualité codé associé à
chaque amplifiat.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X] : les fichiers sont stockés dans
1 dossier pour chaque ligne.
[Cycle].bcl.bgzf, où [Cycle] représente le numéro de cycle à 4 chiffres.
Les fichiers de définition des bases sont compressés à l'aide de la
compression en bloc gzip.
Fichier d'index Pour chaque ligne, un fichier d'index binaire répertorie les informations de la
de définition des plaque d'origine dans une paire de valeurs pour chaque plaque, qui sont le
bases numéro de la plaque et le nombre d'amplifiats de la plaque.
Les fichiers d'index de définition des bases sont créés la première fois qu'un
fichier de définition de bases est créé pour cette ligne.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X] : les fichiers sont stockés dans
1 dossier pour chaque ligne.
s_[Lane].bci
Fichiers Pour chaque plaque, les coordonnées XY de chaque amplifiat sont agrégées
d'emplacement en 1 fichier d'emplacement d'amplifiat pour chaque ligne. Les fichiers
des amplifiats d'emplacement des amplifiats sont le résultat de la génération de modèles.
Data\Intensities\L00[X] : les fichiers sont stockés dans 1 dossier pour
chaque ligne.
s_[lane].locs
Fichiers de Le fichier de filtrage spécifie si un amplifiat a franchi les filtres. Les
filtrage informations de filtrage sont regroupées en 1 fichier de filtre pour chaque
ligne et lecture.
Les fichiers de filtrage sont générés au cycle 26 et portent sur 25 cycles de
données.
Data\Intensities\BaseCalls\L00[X] : les fichiers sont stockés dans
1 dossier pour chaque ligne.
s_[lane].filter
Fichiers InterOp Fichiers de rapports binaires. Les fichiers InterOp sont mis à jour tout au
long de la série.
Dossier InterOp
Document n° 1000000009513 v08
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT.
77