illumina NextSeq 550Dx Guide De Référence page 79

Guide de référence de l'instrument NextSeq 550Dx
Type de fichiers Description
Fichiers Les fichiers de localisation des amplifiats (*.locs) contiennent les
d'emplacement coordonnées X,Y de chaque amplifiat dans une plaque. Un fichier
des amplifiats d'emplacement des amplifiats est généré pour chaque ligne pendant la
génération du modèle.
Fichiers d'index Un fichier d'index de génération des bases (*.bci) est produit pour chaque
de définition des ligne afin de préserver les informations de la plaque d'origine. Le fichier
bases d'index contient une paire de valeurs pour chaque plaque, à savoir le
nombre de plaques et le nombre d'amplifiats pour cette plaque.
RTA2 fournit des mesures en temps réel de la qualité de la série, stockées sous forme de fichiers
InterOp. Les fichiers InterOp sont des sorties binaires contenant des mesures au niveau de la plaque, du
cycle et de la lecture.
Gestion des erreurs
RTA2 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier RTALogs (Journaux). Les erreurs sont
enregistrées dans un fichier d'erreurs au format *.tsv.
Les fichiers journaux et d'erreur suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du
traitement :
• *GlobalLog*.tsv résume les activités d'une série importantes.
*LaneNLog*.tsv répertorie les événements de traitement pour chaque ligne.
•
*Error*.tsv répertorie les erreurs survenues au cours d'une série.
•
*WarningLog*.tsv répertorie les avertissements reçus au cours d'une série.
•
Universal Copy Service
Le NextSeq 550Dx comprend un service de copie universel. RTA2 demande au service de copier des
fichiers d'un emplacement source vers un emplacement de destination et le service traite les demandes
de copie dans l'ordre où il les reçoit. Si une exception se produit, le fichier est remis en attente de copie
en fonction du nombre de fichiers dans la file d'attente de copie.
Flux de travail de Real-Time Analysis
Génération de modèle
Enregistrement et
extraction des
intensités
Document n° 1000000009513 v08
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT.
Mappe les emplacements des amplifiats.
Enregistre l'emplacement de chaque amplifiat sur la flow cell et détermine
une valeur d'intensité pour chaque amplifiat.
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