Table des Matières
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Guide du système de séquençage iSeq 100
Structure du dossier de sortie
Recipe : fichier de formule propre à l'analyse.
Logs : fichiers de journaux décrivant les étapes des analyses sur l'instrument, les étapes de
fonctionnement et d'autres événements.
Config : paramètres de configuration de l'analyse.
RunParameters.xml
RunInfo.xml
CopyComplete.txt
RunCompletionStatus.txt
RTAComplete.txt
RTAConfiguration.xml
Data (Données)
Intensities (Intensités)
BaseCalls (Définitions des bases)
L001
s.locs
InterOp
Images
SampleSheet.csv : feuille d'échantillons ou manifeste d'échantillons.
RTALogs : fichiers journaux décrivant les événements de RTA2.
Gestion des erreurs
RTA2 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier RTALogs. Les erreurs sont enregistrées dans
un fichier d'erreurs au format TSV.
Les fichiers journaux et d'erreurs suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du
traitement :
*GlobalLog*.tsv récapitule les événements importants survenus pendant l'analyse.
u
*Error*.tsv répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
u
*WarningLog*.tsv répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
u
Flux de travail de Real-Time Analysis
Extraction des intensités
Correction de la mise en
phase
Définition des bases
Notation de la qualité
Document nº 1000000036024 v05 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
Détermine une valeur d'intensité pour chaque amplifiat.
Corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase.
Détermine une définition des bases pour chaque amplifiat.
Attribue un score de qualité à chaque définition des bases.
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