Configurer Une Analyse De Séquençage (Mode Manuel) - illumina iSeq 100 Manuel Système

Guide du système de séquençage iSeq 100
Surveiller la progression de l'analyse
1 Surveillez la progression de l'analyse et les indicateurs au fur et à mesure qu'ils apparaissent à l'écran de
séquençage après le cycle 26.
Indicateurs
%Q30 Read 1 (% Q30 de la lecture 1)
%Q30 Read 2 (% Q30 de la lecture 2)
%Clusters PF (% d'amplifiats passant
le filtre)
%Occupancy (% d'occupation)
Projected Total Yield (Rendement total
attendu)
2 Pour surveiller le processus de copie des fichiers et les autres processus d'analyse, sélectionnez le menu
du logiciel de commande, puis Process Management (Gestion du processus).
Décharger les consommables
1 Lorsque le séquençage est terminé, sélectionnez Eject Cartridge (Éjecter la cartouche).
Le logiciel éjecte la cartouche utilisée de l'instrument.
2 Retirez la cartouche du plateau.
3 Sortez la Flow Cell de la cartouche.
4 Mettez au rebut la Flow Cell, qui contient des composants électroniques, conformément aux normes
applicables dans votre région.
5 Mettez au rebut la cartouche, qui contient des réactifs usagés, conformément aux normes applicables
dans votre région.
Les fluides ayant été retirés avec la cartouche, le nettoyage après analyse n'est pas nécessaire.
AVERTISSEMENT
Ce groupe de réactifs contient des produits chimiques potentiellement dangereux. Des risques de
lésions corporelles peuvent survenir par inhalation, ingestion, contact avec la peau et contact avec les
yeux. Portez un équipement de protection, y compris des lunettes, des gants et un sarrau de
laboratoire adapté à l'exposition à ces risques. Traitez les réactifs usagés comme des déchets
chimiques et éliminez-les conformément aux lois et règles régionales, nationales et locales en vigueur.
Pour obtenir des renseignements supplémentaires sur l'environnement, la santé et la sécurité, consultez
la fiche signalétique sur support.illumina.com/sds.html.
6 Sélectionnez Close Door (Fermer la porte) pour recharger le plateau et retourner à l'écran d'accueil.
Le logiciel recharge automatiquement le plateau, et les capteurs confirment le retrait de la cartouche.
Configurer une analyse de séquençage (mode manuel)
Pour configurer une analyse en mode manuel, il est nécessaire de préciser les paramètres de l'analyse dans
le logiciel de commande et d'effectuer l'analyse hors instrument en utilisant une application de votre choix.
Le logiciel sauvegarde les données dans le dossier de sortie précisé pour l'analyse. Pour générer des fichiers
FASTQ, une étape supplémentaire est requise.
Document nº 1000000036024 v05 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
Description
Pourcentage de définition des bases de la lecture 1 ayant un score
de qualité ≥ 30.
Pourcentage de définition des bases de la lecture 2 ayant un score
de qualité ≥ 30.
Pourcentage d'amplifiats passant les filtres de qualité.
Pourcentage des puits de la Flow Cell contenant des amplifiats.
Nombre attendu de définitions des bases pour l'analyse.
30