Qiagen PyroMark Q24 MDx Manuel D'utilisation page 63

Table des Matières

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Couleurs symbolisant la qualité
Bleu : Succès
Jaune : À vérifier
Rouge : Échec
Blanc : Non analysé*
* Soit l'analyse n'est pas prise en charge par le logiciel (par exemple, analyse
des SNP en mode CpG), soit la position variable a été désélectionnée par
l'utilisateur (analyses AQ et CpG uniquement).
Résultats de l'analyse AQ
La fréquence des allèles est affichée sur le pyrogramme, par
exemple
représentée par la couleur de fond du résultat.
A5: YGGATAGYGATTTTTAAYGYGTAAGYGTATA
400
300
200
100
0
Exemple de pyrogramme d'une analyse CpG. Les positions
variables dans les analyses AQ et CpG sont mises en surbrillance par
une couleur de fond bleu-gris tandis que les témoins de traitement par
le bisulfite dans les analyses CpG sont identifiés par une couleur de
fond jaune clair.
Résultats de l'analyse CpG
Le pourcentage de méthylation est indiqué sur le
pyrogramme, par exemple
est représentée par la couleur de fond du résultat.
La vue d'ensemble de la plaque comporte une barre de
méthylation indiquant le niveau de méthylation de chaque
site de dinucléotides CpG dans le puits.
Manuel d'utilisation du PyroMark Q24 MDx 01/2016
et
(InDel). L'évaluation de la qualité est
2%
E
E
S
S
G
G
T
T
C
C
G
G
A
A
C
C
T
T
A
A
T
T
5
10
Procédures de fonctionnement
1%
4%
G
G
T
T
C
C
G
G
A
A
T
T
T
T
G
G
A
A
T
T
C
C
A
A
G
G
15
20
. L'évaluation de la qualité
1%
3%
T
T
C
C
G
G
T
T
A
A
T
T
G
G
T
T
C
C
G
G
T
T
A
A
25
30
5-31

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