Table des Matières
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Glossaire
témoins de réaction du traitement par le bisulfite. La
séquence d'origine (avant traitement par le bisulfite) peut
être saisie dans l'analyse pour vérifier si les témoins suggérés
sont de type C converties en T (lues comme G et A dans
l'analyse inverse) et s'ils conviennent comme témoins. Les
témoins recommandés sont les distributions situées en début
de séquence ou celles représentant l'incorporation d'une
seule base.
Analyses SQA
L'expérience du séquençage d'un grand nombre de matrices
indique que l'ordre de distribution n(CTGA) donne, en
moyenne, la meilleure qualité de séquençage. Des matrices
individuelles peuvent cependant donner de meilleurs
résultats avec un ordre de distribution différent.
Dans la mesure du possible, il convient de concevoir les
analyses SQA qui impliquent la résolution de différentes
séquences de manière à ce que la résolution ne dépende
pas du séquençage précis d'homopolymères. De plus, il peut
être utile que la séquence commence par quelques bases
connues générant de préférence des pics
mononucléotidiques. Ceux-ci peuvent servir de pics de
référence pour faciliter la définition des niveaux de pic dans
les analyses complexes.
Veiller à ce que l'échantillon d'ADN de départ soit pur et que
l'analyse permette l'amplification spécifique ou le
séquençage d'une seule séquence cible de l'échantillon.
Dans le cas contraire, l'analyse peut donner lieu à des
séquences mixtes impossibles à analyser.
Être attentif aux astuces et avertissements indiqués par
l'icône rouge
. Lorsque cette icône apparaît, procéder aux
modifications adaptées.
Manuel d'utilisation du PyroMark Q24 MDx 01/2016
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B-
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