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Faire une pile d'images
Cochez Zstack. Dans le menu Multi Dimensional Acquisition la pile d'image peut s'acquérir de
deux façons: le mode First/Last permet de fixer les limites de la pile alors qu'avec le mode
Center, c'est le centre de la pile qui est fixé.
- First/Last: Cliquer sur Live ou Continuous, déplacez-vous en Z à l'aide de la vis
micrométrique et déterminez le premier et le dernier plan en cliquant sur Set First et Set Last.
Vous pouvez déterminez vous-même le nombre d'images à acquérir ou l'intervalle entre
chaque image. Pour obtenir de meilleurs résultat, cliquez sur le bouton à côté d'Optimal pour
avoir un intervalle entre deux images qui respecte le théorème de Nyquist.
- Center: Cliquer sur Live ou Continuous, déplacez-vous en Z à l'aide de la vis micrométrique
et déterminez le centre de votre pile. Déterminez le nombre d'images à faire et l'intervalle
entre chaque ( l'intervalle le plus adéquat étant celui proposé par le bouton Optimal).
Afin de ne pas avoir de saturation, se mettre en fausse couleur et chercher pour chaque canal
séparément en navigant en z s'il y a un plan plus lumineux que celui sur lequel les réglages
ont été précédemment faits.
Faire des acquisitions au cours du temps
Cochez Time Series et choisissez le nombre de cycles et l'intervalle entre chaque.
Pour ne pas perdre les données si un problème se produit au cours de l'acquisition, faire une
sauvegarde automatique (cf Sauvegarde).
Pour mettre en place le système de régulation de la température et de l'O2, se référer au
chapitre Régulation.
Faire une Mosaïque
Cochez Tile Scan. Déterminez le nombre de lignes et de colonnes de votre mosaïque.
Lors de la sauvegarde de l'acquisition, une seule image représentant la mosaïque sera
sauvegardée et non pas toutes les tuiles séparées.
Acquérir des multipositions
Cochez Positions. Déplacez-vous pour trouver la position souhaitée et cliquez sur Add.
Répéter jusqu'à avoir toutes les positions souhaitées.
Faire une multiposition au cours du temps avec une pile d'images
Il faut tout d'abord se mettre en mode Center pour faire la pile d'images. Il faut ensuite aller
dans Positions et cliquer sur Add lorsque vous être en x, y et en z sur la position souhaitée.
Ajustez le nombre de cycles et l'intervalle entre chaque comme vous le souhaitez.
Sauvegarde
Sélectionnez une image et faîtes un clic droit dessus puis Save.
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Plateau technique d'imagerie cellulaire INFINITy-Purpan
Sophie Allart -
sophie.allart@inserm.fr
- Simon Lachambre -
simon.lachambre@inserm.fr
Tél : 05. 62. 74. 45. 78
05. 31. 54. 79. 01
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