Gestion Des Erreurs; Flux De Travail De Real-Time Analysis; Génération Du Modèle - illumina NextSeq 550Dx Guide De Référence

Guide de référence de l'instrument NextSeq 550Dx

Gestion des erreurs

RTA2 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier RTALogs. Les erreurs sont enregistrées dans
un fichier d'erreurs au format *.tsv.
Les fichiers journaux et d'erreurs suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du
traitement :
*GlobalLog*.tsv récapitule les événements importants survenus pendant l'analyse.
u
*LaneNLog*.tsv répertorie les événements relatifs au traitement de chaque ligne.
u
*Error*.tsv répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
u
*WarningLog*.tsv répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
u
Universal Copy Service
L'instrument NextSeq 550Dx comprend l'Universal Copy Service. RTA2 demande au service de copier des
fichiers situés à un emplacement source vers un emplacement de destination; et le service traite les
demandes de copie dans l'ordre d'arrivée. Si une exception survient, le fichier est remis en file d'attente de
copie en fonction du nombre de fichiers présents dans la file d'attente.
Flux de travail de Real-Time Analysis
Génération du modèle
Enregistrement et extraction
des intensités
Correction de la mise en
phase
Définition des bases
Notation de la qualité
Génération du modèle
La première étape du flux de travail RTA est la génération du modèle, qui définit la position de chaque
amplifiat dans une plaque à l'aide des coordonnées X et Y.
La génération du modèle nécessite les données d'image des cinq premiers cycles de l'analyse. Une fois
l'imagerie du dernier cycle de modèle d'une plaque réalisée, le modèle est généré.
REMARQUE Pour la détection d'un amplifiat pendant la génération du modèle, il doit y avoir au moins une base
autre que G dans les cinq premiers cycles. Pour toutes les séquences d'indexage, RTA2 nécessite au moins une
base autre que G dans les deux premiers cycles.
Le modèle est utilisé comme référence pour l'étape suivante d'enregistrement et l'extraction des intensités.
Les emplacements des amplifiats sur toute la Flow Cell sont écrits dans les fichiers d'emplacement des
amplifiats (*.locs), un pour chaque ligne.
Document nº 1000000009513 v07 FRA
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
Cartes d'emplacement des amplifiats.
Enregistre l'emplacement de chaque amplifiat sur la Flow Cell et détermine une valeur
d'intensité pour chaque amplifiat.
Corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase.
Détermine une définition des bases pour chaque amplifiat.
Attribue un score de qualité à chaque définition des bases.
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