Table des Matières
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Déprotection des phosphates
La méthode recommandée pour éliminer le groupe ß-cyanoéthyle du squelette phosphate
est un traitement utilisant du diéthylamine (DEA) à 20% dans de l'ACN.
La déprotection du phosphate peut également être effectuée avec de l'hydroxyde
d'ammonium concentré. Cependant, cela peut entraîner des modifications des bases
hétérocycliques.
Protection de l'hydroxyle du
sucre (temporaire)
Le groupe 5'-hydroxyle sur le nucléotide entrant est protégé par un groupe 4,4'-dimé-
thoxytrityle (DMTr), comme le montre l'illustration suivante.
Le groupe DMTr acide-labile est stable dans les conditions contrôlées de couplage.
L'absorbance ou la conductivité est mesurée lorsque le DMTr est clivé pour donner une
mesure de l'efficacité du couplage.
Déprotection de l'hydroxyle du sucre
Le groupe d'hydroxyle du sucre est supprimé au début de chaque cycle de synthèse par
traitement à l'acide dichloroacétique (DCA) à 3 % dans du toluène.
ÄKTA oligopilot plus Mode d'emploi 28959748 AE
C Chimie de la synthèse d'oligonucléotides
C.2 Chimie de protection
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