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Chapitre 4 Génération d'amplifiats
Introduction
Flux de travail de la génération d'amplifiats
Effectuer un lavage avant analyse
Sélectionner un protocole
Charger des consommables
Effectuer une vérification avant analyse
Surveiller l'analyse
Décharger les composants de l'analyse
Réaliser un lavage après analyse
Confirmer la distribution des réactifs (facultatif)
Introduction
Toutes les étapes de génération d'amplifiats sont effectuées sur le cBot, à l'exception de la préparation de
librairies pour le séquençage et de la préparation de la plaque des réactifs du cBot. La génération
d'amplifiats pour une Flow Cell rapide consiste simplement en l'hybridation et en la première extension du
modèle. Les étapes restantes sont effectuées sur l'appareil de séquençage.
La configuration de l'instrument cBot pour la génération d'amplifiats comprend les étapes de sélection d'un
protocole, puis de chargement des consommables. Numérisez l'entrée requise, comme les identifiants de
réactif et de Flow Cell, en utilisant le lecteur de codes à barres, ou en sélectionnant l'icône du clavier et en
entrant les identifiants manuellement. La saisie manuelle et l'entrée effectuées par le système sont affichées
sur l'écran.
Préparation des librairies
Avant de configurer le cBot pour la génération d'amplifiats, préparez les librairies pour le séquençage.
La procédure diffère selon le type de librairie et le type de Flow Cell.
La plupart des librairies sur les Flow Cell TruSeq et HiSeq nécessitent une étape de dénaturation et de
u
dilution. Pour obtenir plus de renseignements, consultez le Guide de dénaturation et de dilution des
librairies pour les systèmes HiSeq (document nº 15050107).
Le protocole de dénaturation diffère pour les Flow Cell structurées HiSeq X et HiSeq 3000/4000.
u
Dénaturez les librairies à utiliser avec ces types de Flow Cell uniquement comme décrit dans les
instructions de préparation des réactifs pour votre type de Flow Cell. Pour obtenir plus de
renseignements, consultez la section
Flux de travail de la génération d'amplifiats
Préparez la plaque des réactifs et la Flow Cell. Consultez la section
page 12.
Préparez des librairies pour le séquençage et chargez les librairies dans une barrette de huit tubes.
Effectuez un lavage avant analyse.
Document nº 15006165 v05 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Préparation des réactifs à la
page 12.
Préparation des réactifs à la
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