Flux De Travail De Réhybridation - illumina NextSeq 550Dx Guide De Référence De L'instrument

Guide de référence de l'instrument NextSeq 550Dx en mode recherche
Lorsque l'analyse s'interrompt, une boîte de dialogue s'ouvre et propose à l'utilisateur de soulever les
dispositifs d'aspiration et de vider le réservoir plein.
Vider le réservoir des réactifs usagés
1 Sélectionnez Raise Sippers (Soulever les dispositifs d'aspiration).
2 Retirez le réservoir à réactifs usagés et jetez le contenu de manière appropriée.
3 Remettez le réservoir vide dans le compartiment de tampon.
4 Sélectionnez Continue (Continuer). L'analyse reprend automatiquement.
Flux de travail de réhybridation
Une analyse de réhybridation peut s'avérer nécessaire si les indicateurs générés au cours des quelques
premiers cycles montrent des intensités inférieures à 2 500. Toutefois, on s'attend à ce que certaines librairies
à faible diversité aient des intensités inférieures à 1 000, ce qui ne peut être résolu par une réhybridation.
REMARQUE
L'utilisation de la commande End Run (Terminer l'analyse) est définitive. L'analyse ne peut pas reprendre,
les consommables ne peuvent pas être réutilisés et les données de séquençage de l'analyse ne sont pas
enregistrées.
Lorsque vous arrêtez une analyse, le logiciel effectue les étapes suivantes avant de terminer l'analyse :
Il place la Flow Cell en état de sécurité.
u
Il déverrouille la RFID de la Flow Cell pour une future analyse.
u
Il attribue une date de péremption de réhybridation à la Flow Cell.
u
Il écrit les journaux de l'analyse pour les cycles terminés. Un délai est normal.
u
Il ignore le lavage automatique après analyse.
u
Lorsque vous démarrez une analyse de réhybridation, le logiciel effectue les étapes d'analyse suivantes :
Il crée un dossier d'analyse basé sur le nom unique de l'analyse.
u
Il vérifie que la date de réhybridation de la Flow Cell n'est pas arrivée à expiration.
u
Il amorce les réactifs. Un délai est normal.
u
Il ignore l'étape de génération d'amplifiats.
u
Il retire le primer de lecture 1 précédent.
u
Il hybride un nouveau primer de lecture 1.
u
Il continue la lecture 1 et le reste de l'analyse selon les paramètres de l'analyse spécifiés.
u
À quel moment arrêter une analyse pour réhybridation
Une réhybridation ultérieure n'est possible que si vous arrêtez l'analyse aux moments suivants :
Après le cycle 5 : les intensités apparaissent après l'enregistrement du modèle, qui nécessite les
u
cinq premiers cycles du séquençage. Bien qu'il soit sûr d'arrêter l'analyse après le cycle 1, il est
recommandé d'attendre la fin du cycle 5. N'arrêtez pas une analyse au cours de la génération
d'amplifiats.
Lecture 1 ou lecture d'index 1 : arrêtez l'analyse avant que ne commence la resynthèse des paires de
u
bases appariées. La Flow Cell ne peut pas être enregistrée pour une réhybridation ultérieure après le
début de la resynthèse appariée.
Document nº 1000000041922 v01 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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