Guide de référence de l'instrument NextSeq 550Dx en mode recherche
Fichiers de groupement : les fichiers de groupement décrivent les positions des amplifiats pour la puce à
u
ADN de génotypage d'Illumina et sont utilisés lors de l'analyse de données pour effectuer le typage
génotypique. Les fichiers de groupement utilisent le format de fichier *.egt.
L'emplacement des fichiers est défini dans l'écran BeadChip Scan Configuration (Configuration des
balayages de la puce BeadChip). Depuis l'écran d'accueil NCS, sélectionnez Manage Instrument (Gérer
l'instrument), System Configuration (Configuration du système), puis BeadChip Scan Configuration
(Configuration des balayages de la puce BeadChip).
Lorsque l'instrument NextSeq 550Dx est installé, le représentant d'Illumina télécharge ces fichiers et indique
le chemin dans le logiciel de commande. Il n'est pas nécessaire de modifier ces fichiers, sauf en cas de perte
ou de disponibilité d'une mise à jour. Pour obtenir plus de renseignements, consultez
de manifeste et les fichiers de groupement ,
Flux de travail de balayage
Téléchargez les renseignements DMAP et enregistrez-les dans l'emplacement spécifié de dossier DMAP.
Chargez la puce BeadChip dans l'adaptateur de puce BeadChip.
Chargez l'adaptateur de puce BeadChip dans l'instrument.
Indiquez les paramètres de balayage : emplacement du dossier DMAP et emplacement de sortie.
Examinez les résultats de la vérification automatique.
Sélectionnez Start (Démarrer).
Surveillez le balayage à partir de l'interface du logiciel de commande.
Télécharger le dossier DMAP
Le dossier DMAP est accessible à l'aide du Decode File Client par compte ou puce BeadChip (affichage par
défaut).
Accéder au dossier DMAP par compte
1
Depuis l'onglet principal du Decode File Client, sélectionnez une option de téléchargement :
AutoPilot (Pilote automatique)
u
All BeadChips not yet downloaded (Toutes les puces BeadChip non encore téléchargées)
u
All BeadChips (Toutes les puces BeadChip)
u
BeadChips by Purchase Order (Puces BeadChip par bon de commande)
u
Document nº 1000000041922 v01 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
page 52.
Remplacer les fichiers
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