Agilent Technologies G2565CA Guide D'utilisation page 52

3 Modification des paramètres de numérisation

XDR (Rapport
52 Guide d'utilisation du système de scanner de puces à ADN Agilent G2565CA (Logiciel Scan Control 8.4)
Avant la mise à disposition de la plage dynamique TIFF 20 bits,
XDR)
on utilisait la fonction eXtended Dynamic Range (XDR) sur le
scanner et sur le logiciel Feature Extraction, afin de capturer
toutes les données numérisées entre les motifs à signal très
faible et les motifs à signal très fort. Pour capturer toute la plage
dynamique des données, il est désormais possible d'utiliser le
mode TIFF 20 bits au lieu de la fonction XDR.
Lorsque la fonction XDR est active, le scanner numérise chaque
diapositive deux fois, avec des niveaux de sensibilité de PMT
différents. On obtient ainsi deux images liées, que le logiciel
Feature Extraction analyse ensemble pour créer un seul jeu de
données d'intensité allant du simple au millionième et au-delà.
Le niveau de sensibilité supérieur est défini par le gain du PMT
rouge ou vert. Une fois activée, la fonction XDR est
automatiquement désactivée aux valeurs inférieures à 10 %.
Lorsqu'un rapport XDR est défini, le scanner effectue une
deuxième numérisation avec des paramètres de PMT plus bas.
Par exemple, si les PMT rouge et vert sont réglés sur 100 %, et
que le rapport XDR est réglé sur 0,1, la deuxième numérisation
sera effectuée avec un réglage de 10 % pour les PMT. Le plus bas
paramètre de PMT disponible est de 1 %.
Output path
Le bouton de navigation permet de sélectionner un répertoire
(Chemin de
de stockage des données de chaque numérisation. Agilent
sortie)
recommande d'enregistrer les données dans un répertoire local
d'un disque dur secondaire. Il est également possible de
sélectionner un répertoire réseau. En cas de problème pendant
la numérisation, les données seront enregistrées dans un
dossier local temporaire et un avertissement apparaîtra dans le
rapport sur la série de numérisations.
Description
Description de chaque diapositive numérisée. Ces informations
sont intégrées aux données informatiques consultables dans le
logiciel Feature Extraction.