Principes de fonctionnement
Positionnement des diapositives
Excitation par laser
Balayage
Guide d'utilisation du système de scanner de puces à ADN Agilent G2565CA (Logiciel Scan Control 8.4)
Cette section décrit les caractéristiques de fonctionnement du
scanner de puces à ADN Agilent G2565CA.
Le scanner de puces à ADN peut accueillir 48 diapositives de
25,4 x 76,2 mm (1" 3") dans un panier amovible. Lors d'une
série de numérisations, les diapositives sont mises en position
de numérisation, numérisées, puis replacées dans le panier,
les unes après les autres.
Le scanner de puces à ADN utilise deux lasers : un laser YAG à
doublage de fréquence (532 nm) et un laser à hélium-néon
(633 nm). Ces lasers excitent de l'ADN ou de l'ARN marqué à la
cyanine 3 (Cy-3) et à la cyanine 5 (Cy-5) afin de mesurer la
fluorescence après hybridation entre l'acide nucléique cible et
les sondes de la puce à ADN. Il est également possible d'utiliser
des colorants similaires à la Cy-3 et à la Cy-5 (par exemple,
colorants Alexa 647, 655 et 660).
Le scanner de puces à ADN est optimisé pour fournir un haut
rapport signal/bruit dans les bandes d'émission de la Cy-3
(550 à 610 nm) et de la Cy-5 (650 à 750 nm) avec une grande
plage dynamique (jusqu'à 10
spectrale. Ces caractéristiques permettent une très large plage
de concentrations cibles et une plus grande fiabilité des
données aux niveaux de signal faibles.
Le laser balaie rapidement la puce à ADN dans les deux sens.
La fonction d'autofocus dynamique garantit le placement
systématique de la puce dans le plan focal de la lentille du laser,
donc l'uniformité du balayage.
Introduction
Positionnement des diapositives
5
) et une faible intermodulation
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