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Chapitre 4 Génération d'amplifiats avec suivi
des échantillons
Introduction
Flux de travail de la génération d'amplifiats avec suivi des échantillons
Lavage avant analyse
Chargement des consommables
Chargement du collecteur
Sélection du protocole
Numérisation des consommables
Vérification avant analyse
Surveillance de l'analyse
Déchargement des composants de l'analyse
Lavage après analyse
Confirmation de la distribution des réactifs (facultatif)
Introduction
Il est possible de générer des amplifiats avec un suivi d'échantillons pour toutes les Flow Cells HiSeq. Toutes
les étapes de génération d'amplifiats sont effectuées sur le système cBot, à l'exception de la préparation de
librairies pour le séquençage et de la préparation des réactifs. La génération d'amplifiats pour une Flow Cell
HiSeq Rapid v2 consiste simplement en l'hybridation et en la première extension du modèle. Les étapes
restantes sont effectuées sur le HiSeq.
La configuration du système cBot pour la génération d'amplifiats avec suivi des échantillons comprend des
étapes de chargement des composants de l'analyse, de sélection d'un protocole et de numérisation des
consommables. Les lecteurs internes enregistrent les entrées obligatoires, telles que les identifiants des
réactifs et de la Flow Cell, après le chargement des consommables et la fermeture du couvercle de
l'instrument. La saisie manuelle et l'entrée effectuées par le système sont affichées sur l'écran si nécessaire.
Pour plus de renseignements sur la configuration de votre cBot pour le suivi des échantillons, consultez le
Guide de configuration du système cBot (document nº 1000000005301).
Préparation des librairies
Avant de configurer le système cBot pour la génération d'amplifiats, préparez les librairies pour le
séquençage. La procédure diffère selon le type de librairie et le type de Flow Cell.
La plupart des librairies sur les Flow Cells TruSeq et HiSeq nécessitent une étape de dénaturation et de
u
dilution. Pour plus de renseignements, consultez le Guide de dénaturation et de dilution de librairies des
systèmes HiSeq (document nº 15050107).
Le protocole de dénaturation diffère pour les Flow Cells structurées HiSeq X et HiSeq 3000/4000.
u
Dénaturez les librairies à utiliser avec ces types de Flow Cell uniquement comme décrit dans les
instructions de préparation des réactifs pour votre type de Flow Cell. Pour obtenir plus de
renseignements, consultez la section
Document nº 15065681 v05 FRA Support nº 20015507
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Préparation des réactifs à la
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