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illumina cBot 2 Guide page 23

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Guide du système cBot 2
6
Ouvrez l'emballage double coque et sortez la Flow Cell.
Figure 10 Retrait de la Flow Cell de l'emballage double coque
7
Nettoyez la Flow Cell avec un chiffon non pelucheux imbibé d'alcool.
8
Séchez à l'aide d'un tissu non pelucheux.
9
Réservez à température ambiante.
Décongélation de la plaque des réactifs cBot
1
Retirez la plaque des réactifs du cBot de son lieu de stockage à une température entre -25 et -15 °C.
2
Décongelez dans un bain d'eau à température ambiante (de 19 ºC à 25 ºC) pendant au moins
60 minutes.
Les plaques des réactifs doivent être utilisées le jour même de leur décongélation.
Décongélation des réactifs EPX1, EPX2, EPX3 et RSB
1
Retirez le EPX1, le EPX2, le EPX3 et le RSB de leur lieu de stockage entre -25 et -15 °C.
2
Décongelez à température ambiante pendant 10 minutes.
3
Réservez sur de la glace.
Préparation d'une nouvelle dilution de NaOH
1
Combinez les volumes suivants dans un tube de microcentrifugeuse :
Eau de laboratoire (900 µl)
u
Stock de NaOH 1 N (100 µl)
u
Ces volumes permettent d'obtenir 1 ml de NaOH 0,1 N.
2
Inversez pour mélanger.
Dénaturation des librairies et ajout d'un contrôle PhiX facultatif
La concentration de chargement d'une librairie dépend de la librairie à séquencer. Les instructions suivantes
s'appliquent aux librairies d'Illumina prises en charge et sous-entendent une taille d'insert type pour le type
de librairie associé. Assurez-vous de diluer à une concentration appropriée au type de librairie.
Une concentration de chargement d'ADN trop élevée entraîne une réduction du %PF.
u
Une trop faible concentration de chargement d'ADN entraîne une réduction du %PF ainsi qu'un
u
pourcentage élevé de doublons qui affecte négativement la profondeur de couverture.
1
Diluez la librairie ou le groupement de librairies à la concentration appropriée.
Document nº 15065681 v05 FRA Support nº 20015507
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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