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3 Description du système
3.1 Instrument
3.1
Instrument
Introduction
Le système Ettan Spot Picker est conçu pour exciser et transférer automatiquement des
tampons de gel de polyacrylamide, contenant des protéines, de gels d'électrophorèse
1D ou 2D vers des microplaques. Ces tampons de gel sont adaptés à un traitement ulté-
rieur avant l'analyse par spectrométrie de masse.
Les gels doivent en principe être immobilisés sur un support en plastique ou sur du verre.
Toutefois, des gels sans support peuvent être utilisés en association avec le Ettan Spot
Picker Nonbacked Gel Kit inclus.
Flux de travail typique
Stade
1
2
3
26
Description
Des gels 2D qui ont été post-colorés avec, par exemple, des colorants Co-
omassie™, argent ou SYPRO™, ou colorés par fluorescence avec des pro-
téines CyDye™ DIGE pré-étiquetées sont numérisés.
L'image numérisée est analysée à l'aide de DeCyder™ 2-D Differential Ana-
lysis Software ou autre logiciel approprié et une liste de prélèvements pour
des spots d'intérêt est préparée. Une paire de marqueurs de référence doit
être incluse dans le gel et détectée également durant l'analyse de l'image.
Ces marqueurs de référence sont utilisés pour transformer les coordonnées
d'une image (pixels) en valeurs de distance pour le prélèvement des spots.
Autrement, des spots peuvent être prélevés manuellement sans utiliser une
liste de prélèvement (voir
page
88).
Ettan Spot Picker excise des tampons de gel du gel conformément à la liste
de prélèvement et les injecte dans des microplaques à 96 puits, ainsi qu'un
volume de liquide de distribution.
Prélever un gel sans liste de prélèvement, en
Ettan Spot Picker Mode d'emploi 28-9649-84 AB
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