illumina MiSeqDx avec MOS v4 Guide De Référence page 28

Guide de référence de l'instrument MiSeqDx avec MOS v4
Local Run Manager affiche la progression de l'analyse et l'information de séquençage (Total
d'amplifiats, % d'amplifiats passant le filtre, lecture 1 et lecture 2 %>= Q30 et dernier cycle évalué). Pour
obtenir plus de renseignements, consultez la section
1. À l'écran Sequencing (Séquençage) de l'instrument, surveillez la progression de l'analyse, les
intensités et les scores de qualité qui s'affichent.
Run Progress (Progression de l'analyse) : indique la progression de l'analyse dans une barre
•
d'état, ainsi que le nombre de cycles terminés.
Intensity (Intensité) : indique la valeur des intensités dʼamplifiats du 90
•
chaque plaque.
Le graphique qui se trouve dans la zone Intensity (Intensité) représente le nombre de plaques
imagées.
• Si seule la surface supérieure de la Flow Cell est mise en image, un graphique à une seule
colonne apparaît.
• Si les surfaces supérieure et inférieure de la Flow Cell sont mises en image, un graphique à
deux colonnes apparaît.
A. Indique deux plaques, surface supérieure uniquement
B. Indique quatre plaques, surfaces supérieure et inférieure
• Q-Score All Cycles (Score de qualité de tous les cycles) : indique le pourcentage moyen des
bases supérieures à Q30, qui constitue une mesure de score de qualité. Un score de qualité
représente la probabilité d'obtenir une définition des bases erronée. Les scores de qualité sont
calculés après le cycle 25.
Score de
qualité
Q40
Q30
Q20
Q10
• Cluster Density (K/mm²) (Densité des amplifiats [K/mm²]) : indique le nombre dʼamplifiats par
millimètre carré pour lʼanalyse. Idéalement, la densité des amplifiats est de 800 K/mm².
Document nº 200010452 v00 FRA
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
Probabilité de définition de bases
erronée
1 sur 10 000
1 sur 1 000
1 sur 100
1 sur 10
Logiciel Local Run Manager, page 5.
e
percentile pour
23