illumina MiSeqDx Guide De Référence page 41

Figure 16
Génération du modèle
Real-Time Analysis (RTA) utilise les quatre premiers cycles de l'analyse de séquençage
pour générer le modèle. La génération du modèle est le procédé par lequel les positions des
amplifiats sur la surface entière de la Flow Cell sont définies selon des coordonnées X et Y.
Les images produites par chaque cycle d'imagerie suivant sont alignées sur le modèle de
positions des amplifiats généré. Les intensités individuelles des amplifiats sont extraites
dans les quatre canaux de couleur de nucléotides et les définitions des bases sont créées à
partir des intensités normalisées des amplifiats.
Indicateurs de l'analyse
Les indicateurs de lʼanalyse apparaissent à lʼécran Sequencing (Séquençage) à différents
moments de lʼanalyse. Lors des étapes de génération des amplifiats, aucun indicateur
nʼapparaît.
Après le début du séquençage, les indicateurs suivants apparaissent lors des cycles
indiqués :
Indicateur
Intensité
Intensité et densité des amplifiats
Intensité, densité des amplifiats, % passant le
filtre, rendement et scores de qualité
Guide de référence de l'instrument MiSeqDx avec MOS v2
Écran Sequencing (Séquençage)
Cycle
Cycles 1 à 4 ou cycles 1 à 7, selon la trousse.
Cycles 5 à 25 ou cycles 8 à 25, selon la trousse.
Du cycle 26 jusqu'à la fin de l'analyse, pour
toutes les trousses.
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