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Calculs du calculateur d'oligonucléotides
Calcul
Paramètres de saisie
Nbre de bases
Séquence répétitive de A, T
(ou U), G et C
Taux ou
Utilisez la séquence AT (U) GC
pourcentage de
saisie ci-dessus
GC
Poids moléculaire
Nbre d'unités A, nbre d'unités T,
nbre d'unités G, nbre d'unités C
nbre d'unités U
Absorptivité
Nbre d'unités A, nbre d'unités T,
ε (260)
nbre d'unités G, nbre d'unités C
nbre d'unités U
Facteur de
N/A
conversion
Calcul de T
:
Nbre d'unités A, nbre d'unités T,
m
Oligonucléotides
nbre d'unités G, nbre d'unités C
d'une longueur
maximale de
20 bases
Thermo Scientific
Formule
Décompte du nombre total de bases
saisies.
Nbre de bases G
-------------------------------------------------------------------------- -
%GC =
Nbre total de AT ou U
Si l'entrée n'inclut pas d'unités U :
Poids moléculaire = (312,2 x A) +
(303,2 x T)+ (329.2 x G) +
(289.2 x C) + 18.02
Si l'entrée inclut des unités U :
Poids moléculaire = (329.2 x A) +
(306.2 x U)+ (345.2 x G) +
(305.2 x C) + 18.02
Si l'entrée n'inclut pas d'unités U :
ε
= (15,200 x A) + (8,400 x T)
260
+ (12,010 x G) + (7,050 x C)
Si l'entrée inclut des unités U :
ε
= (15,200 x A) + (9,900 x U)
260
+ (12,010 x G) + (7,050 x C)
3
Poids moléculaire x 10
Coefficient d'extinction
T
= 2(A + T) + (G + C)
m
Unités affichées
Longueur =
nombre de bases
Pourcentage
(
) x 100
+
C
(
) GC
Poids moléculaire =
x Da/M
Coefficient
d'extinction =
-1
M
cm
μg/mL
°C
Manuel d'utilisation du BioMate 3S
27
-1
175
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