Déroulement d'une session
Il reste maintenant 2 paramètres à ajuster : Le Gain (Master) et le Digital Offset.
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Plus précisément :
Dans la section Réglage du panneau « Acquisition Mode » - p.41 – Etape 11, nous avons réglé la dynamique
du capteur sur 8 bit. Cela signifie que les images que nous alons acquérir seront composées de pixels qui
auront des valeurs comprises entre 0 et 255 (soit 256 niveaux de gris).
Le « Gain (Master) » permettra d'amplifier le signal au niveau du photomultiplicateur pour exploiter toute
la dynamique du capteur. C'est-à-dire, amplifier le signal jusqu'à ce que le pixel le plus intense ait la valeur
255 (ce pixel sera alors à la saturation).
Le « Digital Offset » permettra de retirer de l'image finale les pixels de faibles intensités (le « Digital
Offset » retire les pixels de 0 à la valeur d'intensité de votre choix). Ceci permet de supprimer le
background. Attention : Un « Digital Offset » trop fort supprimera de fortes intensités qui correspondent
peut être à votre signal. Assurez-vous que le « Digital Offset » ne risque pas de supprimer votre signal
d'intrêt.
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7. Vérifiez votre focus
Cliquez sur « Locate ».
Ouvrez le shutter.
Choisissez un cube de fluorescence.
Ajustez la mise au point si besoin.
Fermez le shutter.
8. Cliquez sur l'onglet « Acquisition »
*
Attention :
A partir de maintenant, le microscope va utiliser les lasers. Ne prénétrez jamais vos mains ou un objet dans
la zone noire délimitée par la platine.
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9. Cliquez sur « Set Exposure »
pour que le logiciel estime des gains vous permettant d'observer votre échantillon en mode confocal.
Manager »)
Le logiciel fait différents essais de « Gain (Master) » et de « Digital Offset » jusqu'à trouver du signal sur
l'image. Vous pouvez réappuyer sur l'icône « Set Exposure » si la tentative a échouée.
| Version 3.1
Manuel d'Utilisation –
(voir Réalisation de la mise au point – p.24)
Copie d'écran 33: Icônes "Experiment Manager"
Service Commun de Microscopie
Microscope Confocal Zeiss LSM 710 –
:
(Voir Copie d'écran 4 : Logiciel LSM Zen – p.3 – Fenêtre 1 – Zone Onglets)
(voir Copie d'écran 2 : Fenêtre 1 en mode « Acquisition » - Colonne a – Zone « Experiment
Précis
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